MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP05

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013265	TGG	2	6	108	113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013265	CCT	2	6	169	174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013265	GCG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013265	AGCGGT	2	12	230	241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013265	C	6	6	315	320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_013265	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013265	GGC	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013265	ATC	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013265	CCTGC	2	10	430	439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013265	TC	3	6	452	457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013265	TG	3	6	533	538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013265	C	6	6	545	550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_013265	A	6	6	616	621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013265	GCA	2	6	630	635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013265	AAG	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013265	GTG	2	6	684	689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013265	GAA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013265	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
19	NC_013265	AAG	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
20	NC_013265	AT	3	6	883	888	50 %	50 %	0 %	0 %	259647812
21	NC_013265	CAT	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647812
22	NC_013265	TTA	2	6	1031	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647812
23	NC_013265	ACA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647812
24	NC_013265	A	6	6	1095	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	259647812
25	NC_013265	GGAC	2	8	1183	1190	25 %	0 %	50 %	25 %	259647812
26	NC_013265	CAGC	2	8	1218	1225	25 %	0 %	25 %	50 %	259647812
27	NC_013265	ACG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
28	NC_013265	GCGG	2	8	1377	1384	0 %	0 %	75 %	25 %	259647812
29	NC_013265	GCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
30	NC_013265	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
31	NC_013265	AGC	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
32	NC_013265	GCG	2	6	1534	1539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
33	NC_013265	GAAAG	2	10	1601	1610	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013265	GCT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647813
35	NC_013265	A	8	8	1662	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	259647813
36	NC_013265	ATG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
37	NC_013265	GGT	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647813
38	NC_013265	AT	3	6	1913	1918	50 %	50 %	0 %	0 %	259647813
39	NC_013265	ACT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
40	NC_013265	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
41	NC_013265	AGA	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647813
42	NC_013265	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
43	NC_013265	A	6	6	2172	2177	100 %	0 %	0 %	0 %	259647813
44	NC_013265	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013265	GATAT	2	10	2262	2271	40 %	40 %	20 %	0 %	259647814
46	NC_013265	T	6	6	2306	2311	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
47	NC_013265	AAGAT	2	10	2336	2345	60 %	20 %	20 %	0 %	259647814
48	NC_013265	CAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647814
49	NC_013265	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259647814
50	NC_013265	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	259647814
51	NC_013265	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647814
52	NC_013265	CTT	4	12	2452	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
53	NC_013265	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
54	NC_013265	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
55	NC_013265	T	6	6	2521	2526	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
56	NC_013265	AGA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647814
57	NC_013265	TCTT	2	8	2559	2566	0 %	75 %	0 %	25 %	259647814
58	NC_013265	CTT	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
59	NC_013265	A	6	6	2610	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	259647814
60	NC_013265	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647814
61	NC_013265	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
62	NC_013265	CA	4	8	2729	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	259647814
63	NC_013265	T	6	6	2747	2752	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
64	NC_013265	CTC	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013265	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013265	CGGA	2	8	2847	2854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013265	GCA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013265	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
69	NC_013265	CGCTGT	2	12	3046	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
70	NC_013265	TCCAGC	2	12	3064	3075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	259647815
71	NC_013265	CTG	3	9	3081	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
72	NC_013265	CTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
73	NC_013265	GCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
74	NC_013265	CCTG	2	8	3172	3179	0 %	25 %	25 %	50 %	259647815
75	NC_013265	CGCT	2	8	3195	3202	0 %	25 %	25 %	50 %	259647815
76	NC_013265	AGT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
77	NC_013265	CTG	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
78	NC_013265	GCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
79	NC_013265	TGC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
80	NC_013265	TTC	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647815
81	NC_013265	GCA	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
82	NC_013265	CG	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	259647815
83	NC_013265	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
84	NC_013265	CCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
85	NC_013265	GAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
86	NC_013265	GGC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647815
87	NC_013265	TTCTC	2	10	3706	3715	0 %	60 %	0 %	40 %	259647815
88	NC_013265	CTG	3	9	3788	3796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
89	NC_013265	C	6	6	3876	3881	0 %	0 %	0 %	100 %	259647815
90	NC_013265	ATGCTG	2	12	3895	3906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	259647815
91	NC_013265	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647815
92	NC_013265	CAC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
93	NC_013265	CTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
94	NC_013265	GCTTT	2	10	4034	4043	0 %	60 %	20 %	20 %	259647815
95	NC_013265	CCG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
96	NC_013265	GCGG	2	8	4145	4152	0 %	0 %	75 %	25 %	259647815
97	NC_013265	CAG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
98	NC_013265	GCC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
99	NC_013265	T	6	6	4380	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	259647815
100	NC_013265	TCC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259647815
101	NC_013265	GCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
102	NC_013265	CAG	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
103	NC_013265	GCC	3	9	4497	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
104	NC_013265	ATC	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
105	NC_013265	GTT	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259647816
106	NC_013265	AGC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
107	NC_013265	GAAG	2	8	4718	4725	50 %	0 %	50 %	0 %	259647816
108	NC_013265	CAG	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
109	NC_013265	TGC	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013265	CCT	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013265	CGGG	2	8	4894	4901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.